| 図書名 |
発行年 |
| 薬師寺の版木 |
2000年 |
| 寶山寺の版木 |
2001年 |
| 旧練兵場遺跡 |
2002年 |
| 元興寺 |
2002年 |
| 西大寺の版木 |
2002年 |
| 春日大社の版木 |
2003年 |
| 中の池遺跡 ８次 総合運動公園整備事業に伴う埋蔵文化財発掘調査報告書 |
2003年 |
| 桜井の版木 |
2004年 |
| 中近世の地方山岳信仰に関する調査報告書研究報告書 |
2004年 |
| 台湾における道教寺廟建造物装飾彩色の技法画材調査と保存修復方法に関する研究 |
2004年 |
| 平城京右京北辺 |
2005年 |
| 中の池遺跡―第11次調査― |
2005年 |
| 世尊寺の版木 |
2005年 |
| 東アジアにおける自然の模倣（造り物）に関する研究 |
2006年 |
| 當麻寺の版木－西南院－ |
2006年 |
| 川上村白屋地区文化財民俗調査報告書 |
2007年 |
| 平城京左京三条四坊十二坪 平成１８年度発掘調査報告書 |
2007年 |
| 東大寺の版木 |
2007年 |
| 平城京右京一条三坊一坪 平成18年度発掘調査報告書 |
2008年 |
| 平城京左京三条五坊三坪 平成19年度発掘調査報告書 |
2008年 |
| 聖林寺の版木 |
2008年 |
| 平城京左京四条三坊十三坪 |
2009年 |
| 金剛寺の版木 |
2009年 |
| 曲川遺跡発掘調査報告書 |
2009年 |
| 金剛寺の版木（摺写物編） |
2010年 |
| 平安京左京五条一坊二町（壬生寺境内） |
2011年 |
| 萩之本遺跡 平成21年度発掘調査報告書 |
2011年 |
| 金剛山寺の版木 |
2011年 |
| 大藤原京右京北三条五坊 平成22年度発掘調査報告書 |
2011年 |
| 南曽我遺跡 平成20年度発掘調査報告書 |
2011年 |
| 室生寺の版木 |
2012年 |
| 信貴山の版木 －朝護孫子寺・成福院・光明院旧蔵・信貴山奥院－ |
2013年 |
| 藤原京左京二条二坊 平成24年度発掘調査報告書 |
2014年 |
| 信貴山の版木 －千手院－ |
2014年 |
| 千光寺の版木 |
2015年 |
| 羽束師菱川城跡・長岡京跡（長岡京跡第561次調査）宅地開発に伴う埋蔵文化財発掘調査報告書 |
2015年 |
| ならまちの南玄関 －肘塚かいのづか・京終きょうばての歴史文化－ |
2016年 |
| 奈良県三郷町持聖院所蔵 伝解脱上人貞慶五輪塔及び五輪塔地下出土蔵骨器調査報告書 |
2016年 |
| 奈良県桜井市多武峰町石調査報告書 －県道桜井吉野線拡幅工事に伴う町石実測調査－ |
2017年 |
| 平安京跡左京六条二坊十四町・烏丸綾小路遺跡 |
2017年 |
| 石川土城遺跡 －平成28年度発掘調査報告書－ |
2018年 |
| 藤原京右京十二条三坊、石川廃寺 －平成28年度発掘調査報告書－ |
2018年 |
| 平安京左京六条二坊十二町跡・烏丸綾小路遺跡 |
2019年 |
| 藤原京左京二条四坊、出合・膳夫遺跡 －平成29年度発掘調査報告書－ |
2019年 |
| 平安京左京九条三坊九町跡・烏丸町遺跡 |
2019年 |
| 藤原京右京十条三・四坊 －平成30年度発掘調査報告書－ |
2020年 |
| 華厳宗元興寺所蔵歴史資料調査報告書 |
2020年 |
平城京左京三条六坊十一坪 奈良町遺跡（HJG9次）
－令和元年度発掘調査報告書－ |
2021年 |
| 平城京右京一条二坊十一坪（HJB8次）－令和元年度発掘調査報告書－ |
2021年 |
| 華厳宗元興寺所蔵石造物調査報告書 |
2021年 |
| 南都十輪院所蔵文化財総合調査報告書 |
2021年 |
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最近の主な刊行図書 
特別展図録…毎年秋季特別展開催に伴い、図録を発行しております。
定期刊行物…年1回、年報『元興寺文化財研究所 研究報告』